Por: Redação / Web Amazônia
11/12/2009 às 11h33 Atualizada em 08/05/2011 às 22h16
Santarém (Pará) - A Rede Paraense de Genômica e Proteômica (RPGP) montou, durante o workshop "Bioinformática Next-Gen: Montagem e Anotação de Genomas Bacterianos Completos", dois genomas de Corynebacterium pseudotuberculosis e as anotações dos mesmos estão sendo finalizadas.
De acordo com o professor Jerônimo Ruiz, do Instituto Rene Rachou, da Fundação Oswaldo Cruz, de Minas Gerais, coordenador da Bioinformática da RPGP, "os objetivos serão cumpridos. Estamos na fase final de anotação manual dos genomas", afirma Ruiz, que está em Santarém, onde ocorre o evento.
"Atualmente, estamos na fase da curadoria manual e, pela integração desses resultados com aqueles derivados dos inúmeros pipelines de anotação implementados, os pesquisadores serão capazes de estabelecer hipóteses sobre os diferentes aspectos da biologia do organismo estudado e uma possível vacina", informa.
Depois de todo o processo de automatização, os genomas passam por um processo de curadoria - realizado por uma equipe multidisciplinar de pesquisadores. E, segundo Ruiz, são especialistas em banco de dados, biólogos, físicos e farmacêuticos, originários de instituições como a Fundação Oswaldo Cruz (CPqRR) e as universidades federais do Pará, Minas Gerais e Ouro Preto (MG).
Coordenada por Artur Silva, da UFPA, a RPGP é atualmente uma das mais bem conceituadas no país, não apenas pela produção de um grande volume de dados relacionados aos diferentes genomas sequenciados pela rede, mas também pela excelência das análises e publicações resultantes. Outros aspectos importantes são os treinamentos e a formação de recursos humanos, numa área bastante carente no Brasil e no mundo, que é a Bioinformática.
Neste workshop, que começou na segunda-feira (7) e termina nesta sexta-feira (11), os pesquisadores passaram por vários módulos. Num primeiro momento, eles foram introduzidos nas estratégias de montagem dos genomas com dados de sequenciamento de nova geração. Num segundo momento, aprenderam o tratamento de dados e a anotação estrutural e funcional dos genomas que viabilizam estudos comparativos com outros genomas.
De acordo com Ruiz, os resultados destas pesquisas serão apresentados na próxima segunda-feira (14), durante a posse do reitor da Universidade Federal do Oeste do Pará, mas eles também estão inseridos num projeto maior, que pretende identificar os determinantes biológicos da virulência desses organismos, como as ilhas de patogenicidade da C. pseudotuberculosis.
As patologias causadas pelas C. pseudotuberculosis são bastante diferentes, atacando caprinos e ovinos (linfadenite caseosa), equinos (linfangite ulcerativa), bovinos, suínos e cervos (abscessos), e mesmo em camelos (linfadenite), conforme constatado no Paquistão. Os humanos podem contrair linfadenite subaguda crônica quando em contato com animais infectados.
Os impactos na produção agropecuária são grandes, entretanto, o Pará não tem dados consistentes sobre a incidência desta doença, mas, em Minas Gerais, em algumas regiões, cerca de 60% do rebanho está contaminado pelo "mal do caroço", e os rebanhos são sacrificados porque o tratamento é muito caro, informa Ruiz. "Se pensarmos em certas comunidades que desenvolvem uma pecuária de sobrevivência, isto é uma catástrofe, porque eliminar o rebanho é também eliminar a própria cultura destas comunidades, o que provoca um grande impacto social, daí a necessidade destes estudos", conclui.
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